Le marché public ELN_LIMS[i] lancé par l’ULiège vient d’être attribué à RSpace. Une volonté de la part de notre institution de s’inscrire dans une démarche de recherche reproductible et de pouvoir adopter les méthodes de gestion des données ALCOA+[ii].
L'Université de Liège souhaite contribuer à la mise en place de nouveaux outils destinés à améliorer la gestion des données vivantes de la recherche. Cette initiative s'inscrit dans le plan stratégique institutionnel d’amélioration de la qualité en recherche et dans les objectifs de la charte européenne du chercheur (HRS4R) à laquelle nous adhérons déjà depuis plusieurs années.
RSpace est un des rares outils à avoir été développé pour un environnement académique, soutenant la culture scientifique de l’OPEN SCIENCE, vers une recherche transparente et reproductible. L’environnement RSpace peut être décrit comme l’élément central de la gestion des données vivantes. Il est d’une part connecté à divers systèmes de collecte des données, permettant ensuite l’organisation et le partage de ces données, et la génération de métadonnées riches. Il intègre également divers outils de management, de gestion des ressources, de collaboration ou encore de codage. Enfin, RSpace est connecté à divers répertoires tels que Dataverse, FigShare, Open Science Framework ou DMPonline.
A qui s’adresse l’ELN_LIMS ?
L’outil RSpace s’adresse essentiellement aux secteurs des sciences de la santé et des sciences et techniques. Néanmoins, les chercheurs réalisant des recherches quantitatives dans d’autres domaines et brassant ainsi de larges volumes de données numériques pourraient également avoir un intérêt à utiliser RSpace. Dans certains domaines de recherche, bon nombre d’entre eux utilisent déjà GITLab ULiège…Pour certains, GITLab répondra à l’ensemble des besoins de la gestion des données vivantes. Pour d’autres, RSpace s’avèrera être un outil complémentaire indispensable voire incontournable !
Quel intérêt à utiliser RSpace?
- Le stockage adéquat des données
Il est très courant d'avoir des données réparties sur différents stockages et ressources, tels que les disques durs locaux des instruments de mesure, les ordinateurs personnels des chercheurs, les clés USB, les disques durs externes, les partages de groupe. Cependant, les données sans contexte n'ont pas de sens. Ces données deviennent alors inutiles et peuvent même être considérées comme perdues. Il est dès lors de la plus haute importance de disposer d'un mécanisme de sauvegarde adéquat des données.
- Les collaborations et le partage des données en toute sécurité
De nos jours, les collaborations entre groupes de recherche au sein d’une entité locale ou dans différents lieux géographiques à travers le monde sont la norme. Il est donc nécessaire de partager des données et des informations entre les groupes de recherche, en garantissant d’une part l’intégrité des données et d’autre part les règles en terme de propriété intellectuelle. RSpace permet le partage des données au sein d’une même structure, mais également vers l’extérieur. Les données peuvent être partagées en mode lecture seule ou éditable, pour une personne cible ou un large groupe. L’audit trail permet par ailleurs de déterminer qui a accédé aux données et les modifications éventuelles apportées à ces données.
- La traçabilité et la reproductibilité des données
Les principes FAIR de la gestion des données scientifiques stipulent que les données doivent être trouvables, accessibles, interopérables et reproductibles. Ces principes s'appliquent à toutes les données générées dans un laboratoire : données brutes des instruments de mesure, données traitées et données analysées. Les données doivent être stockées, sauvegardées et annotées en toute sécurité avec suffisamment de métadonnées pour être interprétables et reproductibles par toute personne ayant des connaissances suffisantes dans le domaine. L'utilisation de RSpace contribue à garantir l'ÉQUITÉ des données.
L’outil RSpace bénéficie d'une évolution constante pour répondre au mieux aux besoins de ses utilisateurs.
[i] ELN_LIMS : Electronic Lab Notebook - Laboratory Information Management System
[ii] ALCOA+ best practice guidelines and methodologies for good data management, acronyme of data Attributable, Legible, Contemporaneous, Original, and Accurate. In addition, ‘ALCOA+’ guidance recommends that data is also Complete, Consistent, Enduring, and Available.
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